Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KCNV1Q6PIU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNV1Q6PIU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNV1Q6PIU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNV1Q6PIU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KCNV1Q6PIU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNV1Q6PIU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms