Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTR9Q6PD62 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTR9Q6PD62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTR9Q6PD62 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms