Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RETSATQ6NUM9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RETSATQ6NUM9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RETSATQ6NUM9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RETSATQ6NUM9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms