Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms