Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABLIM2Q6H8Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABLIM2Q6H8Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABLIM2Q6H8Q1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABLIM2Q6H8Q1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABLIM2Q6H8Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABLIM2Q6H8Q1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABLIM2Q6H8Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABLIM2Q6H8Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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