Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
WSCD1Q658N2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WSCD1Q658N2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WSCD1Q658N2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WSCD1Q658N2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms