Protein–RNA interactions for Protein: Q5U623

ATF7IP2, Activating transcription factor 7-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IP2Q5U623 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IP2Q5U623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IP2Q5U623 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF7IP2Q5U623 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7IP2Q5U623 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF7IP2Q5U623 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF7IP2Q5U623 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7IP2Q5U623 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7IP2Q5U623 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7IP2Q5U623 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7IP2Q5U623 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms