Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM164Q5U3C3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM164Q5U3C3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms