Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ZC3H13Q5T200 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ZC3H13Q5T200 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZC3H13Q5T200 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZC3H13Q5T200 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ZC3H13Q5T200 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZC3H13Q5T200 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms