Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNZ9

WIPI1, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPI1Q5MNZ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WIPI1Q5MNZ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WIPI1Q5MNZ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPI1Q5MNZ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms