Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM47AQ5JRC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM47AQ5JRC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM47AQ5JRC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM47AQ5JRC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM47AQ5JRC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms