Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CAVIN4Q5BKX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAVIN4Q5BKX8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN4Q5BKX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms