Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTBL2Q562R1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
ACTBL2Q562R1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms