Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf46Q504U0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C4orf46Q504U0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C4orf46Q504U0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms