Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFNL1Q499Z3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLFNL1Q499Z3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLFNL1Q499Z3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLFNL1Q499Z3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLFNL1Q499Z3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms