Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SV2CQ496J9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2CQ496J9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SV2CQ496J9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SV2CQ496J9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.9 ms