Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRED3Q2MJR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPRED3Q2MJR0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRED3Q2MJR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPRED3Q2MJR0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms