Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDK4Q16654 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK4Q16654 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK4Q16654 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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