Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHRNA2Q15822 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CHRNA2Q15822 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHRNA2Q15822 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHRNA2Q15822 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHRNA2Q15822 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms