Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX1Q15475 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX1Q15475 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIX1Q15475 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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