Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NKX1-1Q15270 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NKX1-1Q15270 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NKX1-1Q15270 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NKX1-1Q15270 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NKX1-1Q15270 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms