Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF1Q14990 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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