Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMCO1Q147U7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMCO1Q147U7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMCO1Q147U7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMCO1Q147U7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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