Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTAN1Q13813 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTAN1Q13813 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTAN1Q13813 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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