Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR4Q13639 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR4Q13639 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR4Q13639 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR4Q13639 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR4Q13639 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms