Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRA2AQ13595 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 512.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 27.7
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TRA2AQ13595 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 27.7
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TRA2AQ13595 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.797e-9■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.87e-9■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.147e-9■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 PPP1R12A-206ENST00000547131 897 ntTSL 54.32□□□□□ -1.725e-9■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.87e-9■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 27.6
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TRA2AQ13595 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 27.6
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TRA2AQ13595 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 27.6
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TRA2AQ13595 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 KIF21A-214ENST00000636569 6157 ntTSL 53.41□□□□□ -1.861e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.871e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 CHD2-216ENST00000629104 649 ntTSL 58.64□□□□□ -1.035e-8■■■■■ 27.6
TRA2AQ13595 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 27.5
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