RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.68■□□□□ 0.1
CBX1-205ENST00000495350 ABCC9O60706 1549 aa14.54□□□□□ -0.08
CBX1-205ENST00000495350 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.21□□□□□ -0.13
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.84□□□□□ -0.19
CBX1-205ENST00000495350 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa13.71□□□□□ -0.21
CBX1-205ENST00000495350 NACADO15069 1562 aa13.53□□□□□ -0.24
CBX1-205ENST00000495350 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
CBX1-205ENST00000495350 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.46□□□□□ -0.25
CBX1-205ENST00000495350 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.31□□□□□ -0.28
CBX1-205ENST00000495350 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.24□□□□□ -0.29
CBX1-205ENST00000495350 MYO15BQ96JP2 1530 aa13.23□□□□□ -0.29
CBX1-205ENST00000495350 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.14□□□□□ -0.31
CBX1-205ENST00000495350 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.12□□□□□ -0.31
CBX1-205ENST00000495350 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.1□□□□□ -0.31
CBX1-205ENST00000495350 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.99□□□□□ -0.33
CBX1-205ENST00000495350 SCRIBQ14160 1630 aa12.95□□□□□ -0.34
CBX1-205ENST00000495350 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CBX1-205ENST00000495350 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.93□□□□□ -0.34
CBX1-205ENST00000495350 CUX2O14529 1486 aa12.68□□□□□ -0.38
CBX1-205ENST00000495350 ERCC6Q03468 1493 aa12.64□□□□□ -0.39
CBX1-205ENST00000495350 NCAPD3P42695 1498 aa12.48□□□□□ -0.41
CBX1-205ENST00000495350 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.4□□□□□ -0.42
CBX1-205ENST00000495350 SMARCA2P51531 1590 aa12.39□□□□□ -0.43
CBX1-205ENST00000495350 HMGXB3Q12766 1538 aa12.37□□□□□ -0.43
CBX1-205ENST00000495350 NESP48681 1621 aa12.37□□□□□ -0.43
CBX1-205ENST00000495350 TRIM41Q8WV44 630 aa12.36□□□□□ -0.43
CBX1-205ENST00000495350 SMARCA4P51532 1647 aa12.31□□□□□ -0.44
CBX1-205ENST00000495350 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CBX1-205ENST00000495350 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CBX1-205ENST00000495350 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.26□□□□□ -0.45
CBX1-205ENST00000495350 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.25□□□□□ -0.45
CBX1-205ENST00000495350 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CBX1-205ENST00000495350 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.19□□□□□ -0.46
CBX1-205ENST00000495350 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.17□□□□□ -0.46
CBX1-205ENST00000495350 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.14□□□□□ -0.47
CBX1-205ENST00000495350 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.11□□□□□ -0.47
CBX1-205ENST00000495350 WDR62O43379 1518 aa12.09□□□□□ -0.47
CBX1-205ENST00000495350 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.07□□□□□ -0.48
CBX1-205ENST00000495350 OSCARQ8IYS5 282 aa12.06□□□□□ -0.48
CBX1-205ENST00000495350 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.04□□□□□ -0.48
CBX1-205ENST00000495350 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.98□□□□□ -0.49
CBX1-205ENST00000495350 WIZO95785 1651 aa11.91□□□□□ -0.5
CBX1-205ENST00000495350 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.89□□□□□ -0.51
CBX1-205ENST00000495350 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.89□□□□□ -0.51
CBX1-205ENST00000495350 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.89□□□□□ -0.51
CBX1-205ENST00000495350 CFTRP13569 1480 aa11.89□□□□□ -0.51
CBX1-205ENST00000495350 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CBX1-205ENST00000495350 ARHGEF11O15085 1522 aa11.84□□□□□ -0.51
CBX1-205ENST00000495350 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CBX1-205ENST00000495350 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.8□□□□□ -0.52
CBX1-205ENST00000495350 IFT140Q96RY7 1462 aa11.8□□□□□ -0.52
CBX1-205ENST00000495350 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
CBX1-205ENST00000495350 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
CBX1-205ENST00000495350 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CBX1-205ENST00000495350 PRDM2Q13029 1718 aa11.72□□□□□ -0.53
CBX1-205ENST00000495350 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CBX1-205ENST00000495350 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
CBX1-205ENST00000495350 FBLN2P98095 1184 aa11.7□□□□□ -0.54
CBX1-205ENST00000495350 TOPBP1Q92547 1522 aa11.7□□□□□ -0.54
CBX1-205ENST00000495350 ABCC8Q09428 1581 aa11.69□□□□□ -0.54
CBX1-205ENST00000495350 ARAP1Q96P48 1450 aa11.69□□□□□ -0.54
CBX1-205ENST00000495350 CHD1O14646 1710 aa11.66□□□□□ -0.54
CBX1-205ENST00000495350 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.554e-6■■■□□ 16.4
CBX1-205ENST00000495350 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.63□□□□□ -0.55
CBX1-205ENST00000495350 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.62□□□□□ -0.55
CBX1-205ENST00000495350 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 SYNJ1O43426 1573 aa11.54□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.53□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 SOGA1O94964 1423 aa11.52□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.52□□□□□ -0.56
CBX1-205ENST00000495350 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.52□□□□□ -0.57
CBX1-205ENST00000495350 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CBX1-205ENST00000495350 WDR97A6NE52 1622 aa11.49□□□□□ -0.57
CBX1-205ENST00000495350 GRIN2BQ13224 1484 aa11.46□□□□□ -0.57
CBX1-205ENST00000495350 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.46□□□□□ -0.57
CBX1-205ENST00000495350 SYNJ2O15056 1496 aa11.45□□□□□ -0.58
CBX1-205ENST00000495350 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.45□□□□□ -0.58
CBX1-205ENST00000495350 CUX1P39880 1505 aa11.37□□□□□ -0.59
CBX1-205ENST00000495350 PBRM1Q86U86 1689 aa11.36□□□□□ -0.59
CBX1-205ENST00000495350 GRIN2AQ12879 1464 aa11.31□□□□□ -0.6
CBX1-205ENST00000495350 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.3□□□□□ -0.6
CBX1-205ENST00000495350 CEP170Q5SW79 1584 aa11.29□□□□□ -0.6
CBX1-205ENST00000495350 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.29□□□□□ -0.6
CBX1-205ENST00000495350 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.29□□□□□ -0.6
CBX1-205ENST00000495350 NUP160Q12769 1436 aa11.26□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS12P58397 1594 aa11.25□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.23□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.23□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.22□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 SHROOM2Q13796 1616 aa11.22□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CBX1-205ENST00000495350 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.19□□□□□ -0.62
CBX1-205ENST00000495350 JPH4Q96JJ6 628 aa11.17□□□□□ -0.62
CBX1-205ENST00000495350 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms