Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF6Q13247 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF6Q13247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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