Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXC1Q12948 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXC1Q12948 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXC1Q12948 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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