Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC173Q0VFZ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC173Q0VFZ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC173Q0VFZ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms