Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC38A11Q08AI6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC38A11Q08AI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC38A11Q08AI6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms