Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4BQ07343 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE4BQ07343 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4BQ07343 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4BQ07343 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4BQ07343 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms