Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
COL16A1Q07092 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
COL16A1Q07092 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COL16A1Q07092 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
COL16A1Q07092 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL16A1Q07092 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL16A1Q07092 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.3 ms