Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CALD1Q05682 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CALD1Q05682 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CALD1Q05682 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CALD1Q05682 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CALD1Q05682 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CALD1Q05682 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms