Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP4A11Q02928 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP4A11Q02928 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP4A11Q02928 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP4A11Q02928 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP4A11Q02928 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms