Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
TOP2BQ02880 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TOP2BQ02880 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TOP2BQ02880 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
TOP2BQ02880 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.3
TOP2BQ02880 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms