Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCN7AQ01118 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SCN7AQ01118 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCN7AQ01118 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SCN7AQ01118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms