Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PITPNAQ00169 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNAQ00169 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNAQ00169 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNAQ00169 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNAQ00169 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNAQ00169 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNAQ00169 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNAQ00169 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNAQ00169 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNAQ00169 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNAQ00169 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNAQ00169 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNAQ00169 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNAQ00169 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNAQ00169 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITPNAQ00169 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITPNAQ00169 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITPNAQ00169 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNAQ00169 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNAQ00169 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNAQ00169 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNAQ00169 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNAQ00169 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNAQ00169 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNAQ00169 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNAQ00169 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNAQ00169 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITPNAQ00169 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITPNAQ00169 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITPNAQ00169 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PITPNAQ00169 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITPNAQ00169 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms