Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP2R2BQ00005 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP2R2BQ00005 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms