Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPXP78539 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPXP78539 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPXP78539 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPXP78539 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPXP78539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPXP78539 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPXP78539 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPXP78539 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPXP78539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRPXP78539 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRPXP78539 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPXP78539 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPXP78539 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPXP78539 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPXP78539 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPXP78539 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPXP78539 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPXP78539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPXP78539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPXP78539 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPXP78539 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPXP78539 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPXP78539 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPXP78539 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPXP78539 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPXP78539 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPXP78539 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPXP78539 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPXP78539 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRPXP78539 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRPXP78539 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPXP78539 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPXP78539 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRPXP78539 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPXP78539 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPXP78539 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPXP78539 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPXP78539 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPXP78539 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPXP78539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPXP78539 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRPXP78539 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRPXP78539 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPXP78539 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPXP78539 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPXP78539 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPXP78539 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPXP78539 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPXP78539 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPXP78539 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPXP78539 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPXP78539 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPXP78539 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRPXP78539 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms