Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHC1P78364 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHC1P78364 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHC1P78364 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHC1P78364 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHC1P78364 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHC1P78364 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHC1P78364 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHC1P78364 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHC1P78364 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHC1P78364 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHC1P78364 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHC1P78364 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHC1P78364 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHC1P78364 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHC1P78364 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHC1P78364 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHC1P78364 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHC1P78364 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHC1P78364 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHC1P78364 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHC1P78364 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHC1P78364 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHC1P78364 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHC1P78364 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHC1P78364 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHC1P78364 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHC1P78364 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHC1P78364 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHC1P78364 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHC1P78364 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHC1P78364 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHC1P78364 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHC1P78364 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHC1P78364 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHC1P78364 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHC1P78364 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHC1P78364 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHC1P78364 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHC1P78364 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHC1P78364 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHC1P78364 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHC1P78364 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHC1P78364 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHC1P78364 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHC1P78364 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHC1P78364 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC1P78364 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC1P78364 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC1P78364 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC1P78364 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHC1P78364 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHC1P78364 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms