Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKP1P63208 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKP1P63208 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP1P63208 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP1P63208 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP1P63208 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP1P63208 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SKP1P63208 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKP1P63208 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKP1P63208 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKP1P63208 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SKP1P63208 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKP1P63208 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKP1P63208 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKP1P63208 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKP1P63208 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKP1P63208 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKP1P63208 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKP1P63208 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKP1P63208 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKP1P63208 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKP1P63208 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKP1P63208 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKP1P63208 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKP1P63208 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKP1P63208 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKP1P63208 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKP1P63208 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKP1P63208 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKP1P63208 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKP1P63208 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKP1P63208 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKP1P63208 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKP1P63208 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKP1P63208 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKP1P63208 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKP1P63208 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKP1P63208 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKP1P63208 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKP1P63208 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKP1P63208 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKP1P63208 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKP1P63208 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKP1P63208 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKP1P63208 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKP1P63208 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKP1P63208 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKP1P63208 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKP1P63208 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKP1P63208 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKP1P63208 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKP1P63208 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SKP1P63208 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKP1P63208 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKP1P63208 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKP1P63208 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKP1P63208 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKP1P63208 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKP1P63208 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKP1P63208 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKP1P63208 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKP1P63208 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKP1P63208 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKP1P63208 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKP1P63208 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKP1P63208 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKP1P63208 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKP1P63208 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKP1P63208 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKP1P63208 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SKP1P63208 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKP1P63208 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKP1P63208 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKP1P63208 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKP1P63208 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKP1P63208 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKP1P63208 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKP1P63208 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKP1P63208 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKP1P63208 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms