Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPD1P62314 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRPD1P62314 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPD1P62314 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms