Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM3P62310 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM3P62310 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM3P62310 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM3P62310 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM3P62310 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM3P62310 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM3P62310 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM3P62310 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM3P62310 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM3P62310 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM3P62310 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM3P62310 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM3P62310 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSM3P62310 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSM3P62310 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSM3P62310 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSM3P62310 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM3P62310 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM3P62310 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM3P62310 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM3P62310 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM3P62310 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM3P62310 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM3P62310 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM3P62310 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM3P62310 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM3P62310 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM3P62310 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM3P62310 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM3P62310 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM3P62310 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM3P62310 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM3P62310 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM3P62310 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM3P62310 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM3P62310 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM3P62310 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM3P62310 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM3P62310 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM3P62310 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM3P62310 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM3P62310 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM3P62310 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM3P62310 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM3P62310 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM3P62310 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM3P62310 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM3P62310 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM3P62310 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM3P62310 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM3P62310 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM3P62310 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM3P62310 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM3P62310 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM3P62310 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM3P62310 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM3P62310 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM3P62310 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM3P62310 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM3P62310 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM3P62310 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM3P62310 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM3P62310 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM3P62310 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM3P62310 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM3P62310 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM3P62310 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM3P62310 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM3P62310 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM3P62310 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM3P62310 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms