Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NLRP6P59044 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP6P59044 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NLRP6P59044 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NLRP6P59044 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP6P59044 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP6P59044 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NLRP6P59044 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP6P59044 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NLRP6P59044 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NLRP6P59044 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NLRP6P59044 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP6P59044 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP6P59044 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP6P59044 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NLRP6P59044 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NLRP6P59044 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP6P59044 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NLRP6P59044 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NLRP6P59044 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NLRP6P59044 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NLRP6P59044 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms