Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA9P57773 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA9P57773 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA9P57773 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA9P57773 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA9P57773 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJA9P57773 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA9P57773 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJA9P57773 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJA9P57773 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA9P57773 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA9P57773 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA9P57773 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA9P57773 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA9P57773 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJA9P57773 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA9P57773 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA9P57773 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GJA9P57773 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA9P57773 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA9P57773 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJA9P57773 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJA9P57773 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA9P57773 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA9P57773 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA9P57773 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA9P57773 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA9P57773 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA9P57773 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA9P57773 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA9P57773 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA9P57773 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA9P57773 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA9P57773 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA9P57773 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA9P57773 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA9P57773 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA9P57773 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA9P57773 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA9P57773 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA9P57773 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA9P57773 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA9P57773 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA9P57773 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA9P57773 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA9P57773 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA9P57773 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA9P57773 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA9P57773 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA9P57773 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA9P57773 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA9P57773 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA9P57773 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA9P57773 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA9P57773 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GJA9P57773 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA9P57773 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA9P57773 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA9P57773 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA9P57773 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA9P57773 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA9P57773 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA9P57773 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA9P57773 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA9P57773 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA9P57773 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA9P57773 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA9P57773 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA9P57773 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA9P57773 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA9P57773 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA9P57773 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms