Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A3P53794 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A3P53794 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC5A3P53794 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A3P53794 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms