Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMSP52788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMSP52788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMSP52788 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMSP52788 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMSP52788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMSP52788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMSP52788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMSP52788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMSP52788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMSP52788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMSP52788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMSP52788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMSP52788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMSP52788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMSP52788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMSP52788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMSP52788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMSP52788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMSP52788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMSP52788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMSP52788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMSP52788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMSP52788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMSP52788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMSP52788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMSP52788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMSP52788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMSP52788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMSP52788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMSP52788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMSP52788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMSP52788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMSP52788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMSP52788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMSP52788 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMSP52788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMSP52788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMSP52788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMSP52788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMSP52788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMSP52788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMSP52788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMSP52788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMSP52788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMSP52788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMSP52788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMSP52788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMSP52788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMSP52788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMSP52788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMSP52788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMSP52788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMSP52788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMSP52788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMSP52788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMSP52788 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMSP52788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMSP52788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMSP52788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMSP52788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMSP52788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMSP52788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMSP52788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMSP52788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMSP52788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMSP52788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMSP52788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms