Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP11P51784 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP11P51784 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP11P51784 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP11P51784 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP11P51784 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP11P51784 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP11P51784 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP11P51784 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP11P51784 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP11P51784 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP11P51784 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP11P51784 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP11P51784 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP11P51784 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP11P51784 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP11P51784 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP11P51784 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP11P51784 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP11P51784 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP11P51784 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP11P51784 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP11P51784 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP11P51784 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP11P51784 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP11P51784 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP11P51784 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP11P51784 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP11P51784 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP11P51784 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP11P51784 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP11P51784 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP11P51784 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP11P51784 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP11P51784 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP11P51784 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP11P51784 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP11P51784 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP11P51784 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP11P51784 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP11P51784 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP11P51784 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP11P51784 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP11P51784 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP11P51784 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP11P51784 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP11P51784 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP11P51784 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP11P51784 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP11P51784 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP11P51784 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP11P51784 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP11P51784 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP11P51784 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP11P51784 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP11P51784 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP11P51784 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP11P51784 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP11P51784 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP11P51784 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP11P51784 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP11P51784 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP11P51784 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP11P51784 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP11P51784 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP11P51784 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP11P51784 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP11P51784 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP11P51784 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP11P51784 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP11P51784 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP11P51784 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP11P51784 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP11P51784 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP11P51784 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP11P51784 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP11P51784 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP11P51784 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP11P51784 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP11P51784 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP11P51784 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
USP11P51784 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP11P51784 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP11P51784 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP11P51784 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP11P51784 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP11P51784 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP11P51784 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP11P51784 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP11P51784 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP11P51784 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP11P51784 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms