Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB27AP51159 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB27AP51159 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB27AP51159 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB27AP51159 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms